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来源:人民网 近日,中国科学院北京基因组研究所生命与健康大数据中心团队题为“The BIG Data Center: from deposition to integration to translation”(北京基因组研究所生命与健康大数据中心:从存储到整合、再到转化)的研究论文被国际学术期刊《核酸研究》(Nucleic Acids Research)在线发表。这是我国首次以数据中心为模式整体发布我国生命组学数据资源建设情况,标志着我国建设综合性基因组数据资源获得国际同行认可。北京基因组研究所有关人员表示,此前,国际上被认可的生物组学数据中心主要有美国的NCBI、欧洲的EBI及日本的DDBJ,要想在国际期刊发表论文,需要先将自己的原始数据提交到这三个官方指定的数据库中。“中国的生物组学数据产量约占全球的40%,是数据产出大国,却没有能够被国际认可的数据库系统,不得不将自己宝贵的数据资源交给他人代管。”该数据库成为国际上第四个被认可的生物组学数据库。现在包括PNAS(美国国家科学院院刊)、Cell Research(细胞研究)等核心期刊在内的多个国际期刊已经认可把数据提交到BIGD。北京基因组研究所生命与健康大数据中心(BIG Data Center)肩负建成面向国家大数据发展战略的多层次生物组学数据资源系统的重要历史使命。目前的数据资源系统包括高通量测序的原始组学数据...
发布时间: 2016 - 12 - 20
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来源:环球科学/Mo Costandi研究人员发现,肥胖与记忆减退和痴呆之间也存在联系。剑桥大学的露西·奇克(Lucy Cheke)和她的同事邀请了一群人来到他们的实验室做 “寻宝游戏”。这些参与者进入了计算机技术营造的虚拟环境下,在这个环境中会有许多东西掉落在他们的周围,之后他们通过回答一系列的问题来检测他们的记忆力,例如他们把一个特定的东西藏在什么地方。在测试的时候什么因素会影响他们的表现呢?你或许会认为智商是比较重要的因素,而非腰围。但是奇克发现,体重指数(BMI,一种利用身高与体重的比例来衡量胖瘦的方法)和记忆衰退之间具有清晰的联系。在寻宝游戏中,BMI更高的参加者表现得更加糟糕。奇克的研究结果为肥胖与脑萎缩和记忆衰退之间的联系贡献了一点微小的证据,在最近的研究中,这种证据正在变得越来越多。奇克的研究表明,肥胖症可能会引起神经退行性疾病,比如阿尔茨海默病(老年痴呆症)。有趣的是,这个研究也显示肥胖与记忆力之间的关系是双向的:超重或是肥胖不仅仅会影响记忆的功能,也会通过改变我们对此前进食经历的记忆,从而改变我们未来的进食行为。奇克开始对这个领域感兴趣是一个偶然。“当时我正在研究人们想象未来状态的能力,特别是在决定食物方面,”她说道。“如果你处于饥饿状态,你会想象你在未来也是饥饿的,但是肥胖人群做出这类决定就不是基于想象,而是基于对事实的判断。”一种可能性是肥胖会毁坏...
发布时间: 2016 - 12 - 13
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来源:腾讯科学科学家在实验室培育的人造大脑拥有200万颗神经元据英国《数字杂志》网站报道,科学家们现在已经更接近于成功培育出“试管大脑”。这项研究的目的是借助人造大脑研究神经障碍性疾病,并且找到治疗方法,解决数百万人的痛苦。这种大脑类器官也被称为迷你大脑,是由皮肤细胞培育出来的。皮肤细胞首先被培育成干细胞,然后在营养丧失的情况下,只有脑细胞最终能够存活了下来,目前科学家们也无法解答其中的原因。这些脑细胞随后被一种果冻状物质所包围,这些物质就像头骨一样保护着脑细胞。在经过三个月的氧气和营养盐供养之后,这些人造大脑拥有了两百万颗神经元,这是非常庞大的数量,而一只成年老鼠的大脑也只拥有四百万颗神经元。这种人造大脑事实上与我们真正的大脑不同。它们似乎就像一滴液体中的斑点,而且直径只有3到4毫米。然而它的内部结构类似于人类大脑发育的早期阶段。它们就像一个胚胎脑,也拥有由脑灰质和脑白质构成的两个半球,彼此之间通过神经元传递信息。它们与人类大脑一样,由特定的大脑区域构成。总体来说,它们相当于9个周大胎儿的大脑。这些人造大脑的另一个有趣的特征就是它们似乎想要自我生长。这项研究的负责人,英国剑桥医学研究委员会分子生物学实验室的Madeleine Lancaster博士称:“它们就像三年前研究人员培育的心脏细胞一样,神经元似乎想要放电。即使你把一个神经元单独放在培养皿中,它甚至会自我连接进行放电。”科...
发布时间: 2016 - 11 - 29
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来源:腾讯科学英国科学家最新研究表明,物种摄取食物不同将产生DNA差异性据科学新闻网站报道,目前,英国牛津大学研究人员对真核和寄生细菌进行深入研究,发现它们DNA序列差异性归结于摄取食物成分。研究报告合着作者、牛津大学植物科学系史蒂文-凯利(Steven Kelly)博士称,生物体使用从食物中获取的成分作为建筑模块,构造它们的DNA,我们猜测食物成分可以改变生物体的DNA。例如:能否依据素食熊猫可以预测出它们与食肉北极熊之间的基因差异?为了测试这一假设,凯利和同事埃米莉-苏华德(Emily Seward)采集了单群寄生虫样本——真核寄生虫(Kinetoplastida)和细菌寄生虫(Mollicutes),以此作为一个模型系统。这些寄生虫拥有一个共同祖先,但是它们进化感染不同植物和动物宿主体,并吞食不同的食物。凯利博士指出,我们在寄生虫的食物中发现不同等级的氮,这将改变它们的DNA。特别是具有低氮、高糖食物寄生虫的DNA序列,比高氮、高蛋白质食物寄生虫消耗较少营养物质。该研究结果基于研究小组的一项奇特数字模型,揭晓了之前细胞新陈代谢和进化之间隐藏的微妙关系。通过分析寄生虫不同食物的适应性,提供了DNA序列如何被影响的新线索。此外,研究人员通过分析它们基因的DNA序列,发现可能预测出生物体相关的食物。埃米莉指出,目前尚不清楚为什么近亲生物体在基因组成方面会存在差异性,通过组合两个生物...
发布时间: 2016 - 11 - 22
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